fa تشخیص سریع RNA ویروس HIV-1 به وسیله روش Real-time Transcription mediated amplification عمومى General پژوهشي اصیل Original Atricle زمینه و هدف: روش‌های ملکولی متعددی توسعه یافته‌اند که قادرند با حساسیت و ویژگی متفاوتی HIV-1 را در نمونه‌های بالینی تشخیص دهند. در این مقاله نتایج حاصل از یک مطالعۀ ارتباط سنجی در راه اندازی و به کارگیری یک روش Real-time PCR TMA نوین جهت تشخیص هم‌ دمای ویروس HIV-1 ارائه شده است. مواد و روش‌ها: در این مطالعۀ مقطعی، ست پرایمر و پروب Molecular Beacon توسط نرم افزارهای اختصاصی و برای یک ناحیۀ 176 جفت بازی از ژن pol ویروس HIV-1 طراحی شد. برای تعیین حساسیت آنالیتیک واکنش از رقت‌های لگاریتمی 10-107 کپی RNAهای حاصل از رونویسی در آزمایشگاه، به عنوان استاندارد استفاده شد. برای ارزیابی حساسیت و ویژگی کلینیکی واکنش از نمونه‌های با‌لینی‌ استفاده شد که پیش از این مثبت و منفی‌ بودن آنها به وسیلۀ یک تست تجاری معتبر تایید شده بود. یافته‌ها: حساسیت آنالیتیک و کلینیکی این روش به ترتیب معدل 500 کپی در میلی‌لیتر و 3/93 درصد در نظر گرفته شد. پرایمرها و پروب طراحی شده تنها به توالی‌های اختصاصی HIV-1 متصل می‌گردند و مطالعات بیوانفورمانیکی هیچ گونه واکنش متقاطعی با ژنوم سایر ویروس‌های انتقال یابنده از طریق خون و ژنوم انسان نشان ندادند. ویژگی کلینیکی روش نیز به طور تجربی و با بررسی 20 نمونۀ منفی به وسیلۀ روش Real-time TMA راه اندازی شده، مورد آزمایش قرار گرفت و معادل 100 درصد در نظر گرفته شد. نتیجه‌گیری: روشTMA Real-time راه‌اندازی شده به علت دارا بودن سرعت، حساسیت و سادگی می‌تواند به عنوان ابزار مفیدی جهت تشخیص سریع و هم‌ دمای ویروس HIV-1 در نمونه‌های خون و پلاسمای بیماران استفاده شود. Background: Several different molecular methods have been developed that are capable of detecting HIV-1 in clinical specimens with different levels of sensitivity and specificity. This article describes the results of a reliability study on the development and application of a new real-time TMA method for isothermal detection of HIV-1. Materials and Methods: In this ex Primental study, the molecular beacon primer and probe set were designed for a 176-base-pair region of HIV-1 pol gene using a specialized software. Logarithmic serial dilutions from 10-107 copies of an in-vitro transcribed RNA were used for determination of the analytical sensitivity of the assay. Clinical specimens that had previously been evaluated positive or negative by a valid commercial assay were used for assessing the clinical sensitivity and specificity of the assay. Results: The analytical and clinical sensitivities of the assay were determined 500 copies/ml and 93.3%, respectively. The primers and the probe were HIV-1 specific and no cross-reaction was observed with other blood-borne viruses and human genome bioinformatically. The clinical specificity of the developed real-time TMA assay was examined experimentally using 20 negative samples and determined to be 100%. Conclusion: The developed real-time TMA assay can be used as an appropriate tool for the rapid and isothermal detection of HIV-1 in patients' blood and plasma samples. ویروس نقص ایمنی اکتسابی 1، مولکولار بیکن، پروب، تکثیر بواسطه نسخه برداری Human immunodeficiency virus-1, Molecular Beacon, Probe, Transcription mediated amplification 18 25 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1016-2&slc_lang=fa&sid=1 Mahdi Paryan مهدی پریان mparyan@gmail.com 4600319475328460018785 4600319475328460018785 Yes pasteur institute انستیتوپاستور ایران Samira Mohammadi yeganeh سمیرا محمدی یگانه ganeh@gmail.com 4600319475328460018786 4600319475328460018786 No pasteur institute انستیتوپاستور ایران Behzad Khansari nejad بهزاد خوانساری نژاد 4600319475328460018787 4600319475328460018787 No tarbiat modares university تربیت مدرس Mahdieh Mondanizadeh مهدیه موندنی زاده 4600319475328460018788 4600319475328460018788 No medical university of hamedan دانشگاه علوم پزشکی همدان Saeed Paryan سعید پریان 4600319475328460018789 4600319475328460018789 No medical university of mashhad دانشگاه علوم پزشکی مشهد