<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Arak University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك</title_fa>
<short_title>J Arak Uni Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jams.arakmu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>46</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal46</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-5338</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-644X</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/jams</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1391</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2012</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تعیین گروه‎های اصلی ژنتیکی سویه‎های کلینیکی میکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مسلول استان مرکزی از طریق تعیین پلی مورفیسم در ژن‎های gyrA و katG</title_fa>
	<title>Detection of Major Genetic Groups of Mycobacterium tuberculosis isolated from tuberculosis patients in Markazi province by polymorphism determination in kat G and gyr A genes</title>
	<subject_fa>علوم پایه</subject_fa>
	<subject>Basic Sciences</subject>
	<content_type_fa></content_type_fa>
	<content_type></content_type>
	<abstract_fa>زمینه و هدف: تمام اعضای میکوباکتریوم توبرکلوزیس به سه گروه ژنتیکی مختلف بر اساس پلی مورفیسم در دو ژن katG و gyrA تقسیم می‎شوند. تعیین سویه‎های متعلق به هر گروه و به ویژه تشخیص سریع آن، دارای اهمیت ویژه اپیدمیولوژیک است. هدف این تحقیق، تعیین گروه‎های اصلی ژنتیکی سویه‎های کلنیکی میکوباکتریوم توبرکلوزیس می‎باشد. مواد و روش‎ها: در این مطالعه مقطعی، سی و سه نمونه خلط از بیماران مسلول استان مرکزی جمع‎آوری و پس از کشت، مورد جداسازی D‏NA با استفاده از Chelex 100قرار گرفت. شناسایی نمونه‎ها با تشخیص ژن katG با کمک PCR انجام و تائید گردید. موتاسیون در کدون KatG463 با کمک RFLP انجام شد. قطعه 620 bp از ژنkatG و194 bp از ژن gyrA تکثیر و تعیین ترادف شد. یافته‎ها: جستجو و تکثیر قطعه 620-bp ژن katG، روش مناسبی برای تائید مولکولی در تشخیص باکتری بود. این مسئله از نظر فنوتیپی نیز انطباق کامل نشان داد. از میان 33 ایزوله مورد مطالعه، دوازده نمونه، گروه ژنتیکی 1، پانزده نمونه گروه ژنتیکی 2 و شش نمونه گروه ژنتیکی 3 را نشان دادند. بدین ترتیب فراوانی گروه دو به عنوان گروه غالب سویه‎ها در استان مرکزی با فراوانی معادل 5/45 درصد مشخص گردید. نتیجه‎گیری: نتایج این تحقیق بیان‎گر رخداد گروه دو با فراوانی بیشتر در میان سویه‎های کلنیکی استان مرکزی می‎باشند. این مسئله با حساس بودن این سویه‎ها به آنتی‎بیوتیک‎های رایج، انطباق داشته و درخور توجه می‎باشد. در این تحقیق کاربرد سه گانه تست ارائه شده در تعیین هم‎ زمان گروه‎های ژنتیکی، ماهیت باکتری و مقاومت به ایزونیازید اثبات گردید. </abstract_fa>
	<abstract>Background: Differentiation of M. tuberculosis complex organisms were assigned to one of three genotypic groups based on the combinations of polymorphisms at katG codon 463 and gyrA codon 95. Early identification of strains belonging to any particular group is very important. This study was planned to identify major genetic groups of clinically isolated Mycobacterium tuberculosis. Materials and Methods: In this cross sectional study 33 sputum samples were collected from tuberculosis patients of the Markazi province. DNA purification from isolated samples was performed by Chelex 100. Identification of isolates was confirmed by detection of katG gene and the mutation in KatG463 by using PCR method and RFLP respectively. Finally 620-bp of katG gene and 194-bp of gyrA gene purified from PCR product were sequenced. Results: Amplification of 620-bp fragment of katG gene was a good way to confirm the detection of bacteria as a molecular approach. Results of sequencing codon GyrA95 in combination by results of PCR-RFLP determined type of the major genetic group (MGG). Therefore it showed that among the 33 Mycobacterium tuberculosis isolates 12 samples were MGG 1, 15 Samples were MGG2 and 6 samples were MGG 3. Results revealed that MGG 2 was dominant form of M. tuberculosis strains of Markazi province by frequency of 45.5%. Conclusion: Based on the results of this study MGG2 occurrence was more frequent among clinical strains in Markazi province that its accordance with susceptibility of these strains to conventional antibiotics is notable. In this study, three applicable benefits from the test as: MGG typing, molecular detection of M. tuberculosis and bacterial resistance to Isoniazid were proven. </abstract>
	<keyword_fa> gyrA، katG ،میکوباکتریوم توبرکلوزیس، گروه‎های اصلی ژنتیکی</keyword_fa>
	<keyword>Bacterial protein, DNA Gyrase, gyra, katG, Mycobacterium tuberculosis </keyword>
	<start_page>26</start_page>
	<end_page>34</end_page>
	<web_url>http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1096-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Arezo</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Eshghinejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آرزو </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عشقی نژاد فرد </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020128</code>
	<orcid>4600319475328460020128</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Aliasghar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی اصغر </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa> فرازی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020129</code>
	<orcid>4600319475328460020129</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Babak</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Eshrati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بابک</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عشرتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020130</code>
	<orcid>4600319475328460020130</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hamid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Khalili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمید </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خلیلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020131</code>
	<orcid>4600319475328460020131</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mana</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shojapour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مانا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شجاع پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020132</code>
	<orcid>4600319475328460020132</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Aazam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ahmadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اعظم   </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>احمدی  </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmatinam81@yahoo.com</email>
	<code>4600319475328460020133</code>
	<orcid>4600319475328460020133</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohamad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Arjmandzadegan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ارجمندزادگان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>arjomandzadegan@arakmu.ac.ir</email>
	<code>4600319475328460020134</code>
	<orcid>4600319475328460020134</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
