Journal of Arak University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك
J Arak Uni Med Sci
Medical Sciences
http://jams.arakmu.ac.ir
46
journal46
1735-5338
2008-644X
fa
jalali
1391
8
1
gregorian
2012
11
1
15
6
online
1
fulltext
fa
انگشت نگاری ژنومی مایکوباکتریوم توبرکلوزیسهای جدا شده از بیماران سل ریوی استان مرکزی به روش PGRS-RFLP
DNA fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis isolates of pulmonary tuberculosis patients in Markazi province by PGRS-RFLP method
علوم پایه
Basic Sciences
پژوهشي اصیل
Original Atricle
زمینه و هدف: سل معضلی قدیمی است که هم اکنون به عنوان چالشی جدید مطرح شده و با توجه به همسایگی ایران با دو کشور افغانستان و پاکستان که در زمره 22 کشور دارای بیشترین شیوع سل در دنیا هستند ضرورت توجه بیش از پیش ما را به این بیماری متذکر میکند. بنابر این به منظور آگاهی از اپیدمیولوژی مولکولی سل و بررسی میزان تنوع ژنتیکی سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در استان مرکزی، مطالعه حاضر انجام پذیرفت. مواد و روشها: در این مطالعه تجربی تعداد 57 نمونه خلط از بیماران سل ریوی اسمیرمثبت مراجعه کننده به مرکز بهداشت و درمان استان مرکزی، برروی محیطهای اختصاصی کشت داده شدند. سپس DNA ژنومیک جدایهها طبق پروتکل استاندارد سازمان بهداشت جهانی استخراج گردید و با استفاده از روش PCR تعلق این جدایهها به کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس تأیید گردید، سپس DNA ژنومیک توسط آنزیمهای PvuII و AluI مورد هضم آنزیمی قرار گرفت و محصول هضم، الکتروفورز شده و قطعات DNA از طریق ساترن بلاتینگ به غشاءنایلونی با شارژ مثبت منتقل گردیدند و سپس هیبریداسیون با پروب PGRS انجام پذیرفت. در خاتمه قطعات هیبرید شده با استفاده از واکنش آنزیمی شناسایی و مورد آنالیز قرار گرفتند. یافتهها: در طی تایپینگ این جدایهها به روش RFLP، با استفاده از دو آنزیم PvuII و AluI و پروب PGRS، گستره وسیعی از تنوع ژنتیکی نمایان گردید به طوری که به ترتیب 50 و 45 تیپ ژنتیکی شناسایی شد. نتیجهگیری: با توجه به تنوع بالای PGRS در سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس میتوان نتیجهگیری کرد که در جمعیت مورد بررسی اکثر افراد با منشا متفاوت به بیماری سل مبتلا شدهاند، بنابراین فعال شدن مجدد عفونت نقش بیشتری را در گسترش بیماری سل در استان مرکزی داشته است.
Background: Tuberculosis is an old problem that is currently considered a great challenge. Noticing Iran’s borders with Afghanistan and Pakistan, which are among the 22 high burden countries around the world, the present study was conducted to analyze the current molecular epidemiology of TB and survey genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in Markazi province, Iran. Materials and Methods: In this experimental study, 57 sputum specimens from smear positive patients admitted to health centers in Markazi province were cultured on specific mycobacterial culture media. Genomic DNA was extracted by standard protocols of WHO and digested separately by PvuII and AluI. Electrophoresis was performed and DNA fragments were transferred to positively charged nylon membrane by southern blotting method and hybridization by PGRS probe. The hybridized strains were subsequently detected by enzymatic reaction and analyzed. Results: Genotyping of the isolates by PGRS-RFLP with Pvu II and AluI displayed a wide range of genetic diversity so that 50 and 45 genotypes were identified, respectively. Conclusion: Noticing the great diversity of PGRS in the Mycobacterium tuberculosis strains, it can be concluded that in the study population, the majority of the patients hadtuberculosis with different etiologies. Therefore, it seems that reactivation of latent infection has had the main role in the spread of tuberculosis
انگشت نگاری ژنومی، فعالیت مجدد عفونت، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، RFLP
DNA fingerprinting, Mycobacterium tuberculosis, Reactivation, RFLP
35
44
http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1525-1&slc_lang=fa&sid=1
Behnam
Rafiee
بهنام
رفیعی
behnam_r17@yahoo.com
4600319475328460020091
4600319475328460020091
No
Islamic Azad University of Qom
دانشگاه آزاد واحد قم
Nader
Mosavari
نادر
مصوری
nmosavari@yahoo.com
4600319475328460020092
4600319475328460020092
Yes
PPD Production Department, Razi Vaccine & Serum Research Institute, Karaj. Iran
موسسه واکسن و سرم سازی رازی
Ali Asghar
Farazi
علی اصغر
فرازی
farazialiasghar@yahoo.com
4600319475328460020093
4600319475328460020093
No
Department of Infectious diseases , Arak university of medical sciences . Arak-Iran
دانشگاه علوم پزشکی اراک
Razie
Nazari
راضیه
نظری
nazari1102002@yahoo.com
4600319475328460020094
4600319475328460020094
No
Department of Microbiology ,Islamic Azad University of Qom branch ,Qom-Iran
دانشگاه آزاد واحد قم
Rouholah
Keshavarz
روح اله
کشاورز
piroozkeshavarz@yahoo.com
4600319475328460020095
4600319475328460020095
No
PPD Production Department, Razi Vaccine & Serum Research Institute, Karaj. Iran
موسسه واکسن و سرم سازی رازی
Keyvan
Tadayon
کیوان
تدین
mmb093@gmail.com
4600319475328460020096
4600319475328460020096
No
PPD Production Department, Razi Vaccine & Serum Research Institute, Karaj. Iran
موسسه سرم سازی رازی