fa ارتباط بین میزان بیان ژنOprD و حساسیت نسبت به کارباپنم‌ها در سویه‌های پسودوموناس جدا شده از نمونه‌های بالینی به روش qRT-PCR علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle <p style="text-align: justify"><strong>زمینه و هدف</strong>: پسودوموناس آئروژینوزا یکی از شایع‌ترین پاتوژن‌های بیمارستانی با میزان مرگ و میر بالاست. پورین OprD به عنوان یکی از اصلی‌ترین مکانیسم‌های مقاومت در برابر آنتی‌بیوتیک‌های خانواده کارباپنم محسوب می‌شود. هدف از این مطالعه تعیین میزان بیان ژن کدکننده این پورین از طریق qRT-PCR است.</p> <p style="text-align: justify"><strong>مواد و روش‌ها</strong>: در این مطالعه با بررسی 100 سویه پسودوموناس آئروژینوزا، 31 نمونه انتخاب و تست حساسیت آنتی‌بیوتیکی به روش دیسک دیفیوژن برای آنتی‌بیوتیک‌های آمینوگلیکوزید، کینولون‌ها، کارباپنم‌ها و تعیین حداقل غلظت مهار کنندگی برای آنتی‌بیوتیک ایمی پنم انجام گرفت. سپس استخراج RNA و تبدیل آن به cDNA انجام و در مرحله آخر بیان ژن‌های مورد نظر توسط qRT-PCR صورت پذیرفت.</p> <p style="text-align: justify"><strong>یافته‌ها</strong>: از بین 8 آنتی‌بیوتیک انتخاب شده، بیشترین مقاومت نسبت به لووفلوکساسین 19 (2/61 درصد) و هم‌چنین کمترین مقاومت نسبت به ایمی پنم 3 (6/9 درصد) مشاهده گردید. نتایج حداقل غلظت مهار کنندگی آنتی‌بیوتیک ایمی پنم، 12 مورد (7/38 درصد) مقاوم، 13 مورد (93/41 درصد) اینترمدیت و 6 مورد (35/19 درصد) حساس گزارش گردید. ژن OprD در تمام سویه‌ها وجود داشت ولی میزان بیان در سویه‌ها مختلف، به صورت متفاوت مشاهده شد. سویه‌های دارای بیان بالای ژن OprD حساسیت بالایی نسبت به کارباپنم‌ها به ویژه ایمی پنم نشان دادند.</p> <p style="text-align: justify"><strong>نتیجه‌گیری</strong>: شناسایی مکانیسم‌های مقاومت در باکتری‌ها بسیار پیچیده و گسترده است و مکانیسم‌های مختلفی برای یک سری آنتی‌بیوتیک‌های مشابه عمل می‌کنند. OprD عامل اصلی اتصال کارباپنم‌ها بوده و با افزایش بیان این پورین حساسیت باکتری‌ها به این آنتی‌بیوتیک‌ها افزایش می‌یابد.</p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Background</em></strong>: Pseudomonas aeruginosa is one of the most common nosocomial pathogens with high mortality rates. OprD is the major resistance mechanism to carbapeneme antibiotics. The aim of this study was to determine the expression of the genes encoding these efflux pumps using qRT-PCR.</span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Materials and Methods</em></strong>: This study examined 100 strains of Pseudomonas aeruginosa isolated from patients admitted to various hospitals in the Hamedan. Conventional phenotypic tests were used for identifying the 100 collected samples, then 31 samples were selected based on type of collected specimen and antibiotic susceptibility test i.e. antibiotic disk diffusion method performed for aminoglycoside, quinolone and carbapenem antibiotics. Furthermore, MIC method was performed for imipenem. Finally, RNA was extracted and converted to cDNA for determining the efflux pump genes expression using qRT-PCR.</span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Results</em></strong>: Among 8 selected antibiotics, the greatest resistance was for levofloxacin (61.2%, n=19) and the lowest one for imipenem (9.6%, n=3). The results of MIC were to imipenem 12 samples (38.7%) resistant, 13 samples (41.93%) intermediate, and 6 samples (19.35%) sensitive. The OprD gene was present in all strains but different expression has been observed. The strains with over expression of OprD gene showed high sensitivity towards carbapenems family antibiotics especially imipenem. </span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Conclusion</em></strong>: Identifying of bacterial resistance mechanisms is very complicated and extensive due to different mechanisms involved for similar antibiotics. OprD is main cause of attachment to the carbapenems family antibiotics. The more expression of OprD shows the more antibiotic sensitivity.</span></span></p> پسودوموناس آئروژینوزا, حداقل غلظت مهار کنندگی, بیان ژن OprD , qRT-PCR Pseudomonas aeruginosa, MIC, Gene exoression, OprD, qRT-PCR 70 79 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2844-2&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad Reza Arabestani محمد رضا عربستانی mohammad.arabestani@gmail.com 4600319475328460043570 4600319475328460043570 Yes Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Mojtaba Rajabpour مجتبی رجب پور mojtabarajabpoor7144@yahoo.com 4600319475328460043571 4600319475328460043571 No Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Rasoul Yousefi Mashouf رسول یوسفی مشعوف yousefimash@yahoo.com 4600319475328460043572 4600319475328460043572 No Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Mohammad Yusef Alikhani محمد یوسف علیخانی alikhani43@yahoo.com 4600319475328460043573 4600319475328460043573 No Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Seyed Masoud Mousavi سید مسعود موسوی s.masoud.mousavi@gmail.com 4600319475328460043574 4600319475328460043574 No گروه میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران