fa بررسی تنوع ژنتیکی مارکر rs4898352 در ناحیه ژنی F8 به عنوان یک مارکر گویا در مطالعه بیماری هموفیلی A در جمعیت اصفهان علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle <p dir="rtl" style="margin-right: 28.9pt"><strong>زمینه و هدف:</strong> هموفیلی <span dir="ltr">A</span> یک اختلال خون‌ریزی دهنده وابسته به جنس مغلوب است که به علت جهش‌های گوناگون در ژن فاکتور ٨ که پروتئین انعقادی فاکتور 8 را کد می‌کند، رخ می‌دهد. با توجه به درجه بالای هتروژنی جهش‌ها، بزرگی اندازه (<span dir="ltr">kb</span>١٨٦) و پیچیدگی ساختار ژن فاکتور ٨، آنالیز مستقیم جهش‌ها پرهزینه و زمان‌بر است. بنابراین آنالیز پیوستگی با استفاده از مارکرهای پلی‌مورفیسم اطلاع دهنده مانند مارکرهای پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (<span dir="ltr">SNP</span>)، به عنوان روشی سریع و مقرون به صرفه برای تشخیص حاملین هموفیلی <span dir="ltr">A</span> در خانواده‌های بیمار معرفی شده است. مارکرهای چند شکلی تک نوکلئوتیدی متعددی در ناحیه ژنی <span dir="ltr">F8</span> گزارش شده است.</p> <p dir="rtl" style="margin-right: 28.9pt"><strong>مواد و روش</strong>‌<strong>ها:</strong> در این مطالعه تجربی، خصوصیـات و هم‌چنین اطلاع دهندگـی مارکر&nbsp; <span dir="ltr">A/T SNP</span> <span dir="ltr">(rs4898352)</span> واقع در اینترون 18 ناحیه ژنی <span dir="ltr">F8</span> در جمعیت اصفهان مـورد مطالعه قرار گرفت. تعیین ژنوتیپ مارکر <span dir="ltr">rs4898352</span> با استفاده از تکنیک <span dir="ltr">tetra primer ARMS PCR</span> و به دنبال آن الکتروفورز با ژل آگارز در 140 زن سـالم غیرخویشـاوند در جمعیـت مزبور انجام شد. آغازگرهای جدید با استفاده از نرم افزار الیگو 7 برای مارکر <span dir="ltr">rs4898352</span> طراحی شدند. برای تعیین میزان فراوانی آللی، درجه هتروزیگوسیتی و تعادل هاردی-وینبرگ از نرم افزار <span dir="ltr">GenePop</span> و برای تخمین مقدار فاکتور ظرفیت اطلاعاتی پلی مورفیسم <span dir="ltr">(PIC)</span> از نرم افزار <span dir="ltr">Powermarker</span> استفاده شد.</p> <p dir="rtl" style="margin-right: 28.9pt"><strong>یافته</strong>‌<strong>ها:</strong> نتایج نشان دادندکه فراوانی آللی پلی‌مورفیسم <span dir="ltr">rs4898352</span> برای آلل <span dir="ltr">A</span> و <span dir="ltr">T</span> به ترتیب ٤٨٢/٠ و ٥١٨/ می‌باشد. میزان هتروزیگوسیتی مشاهده شده ٦٠ درصد بود و مشخص شد که جمعیت اصفهان برای مارکر <span dir="ltr">rs4898352</span> در تعادل هاردی-وینبرگ می‌باشد(05/0<span dir="ltr">p></span>). به علاوه، بررسی مقدار <span dir="ltr">PIC</span> مارکر مزبور حاکی از اطلاع دهندگی شدید آن در جمعیت اصفهان می‌باشد.</p> <p dir="rtl" style="margin-right: 28.9pt"><strong>نتیجه</strong>‌<strong>گیری:</strong> به طور کلی، داده‌ها نشان دادند که مارکر <span dir="ltr">rs4898352</span> را می‌توان به عنوان یک مارکر آگاهی‌دهنده در بررسی مولکولی بیماری هموفیلی <span dir="ltr">A</span> در جمعیت اصفهان معرفی کرد.</p> <p class="MsoNormal" style="text-align: justify line-height: normal text-indent: 36pt margin: 0cm 0cm 0pt mso-layout-grid-align: none"><font size="3"><font color="#000000"><b><i><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-bidi-font-family: 'B Zar'">Background:</span></i></b><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-bidi-font-family: 'B Zar'"> Hemophilia A is an X-linked bleeding disorder caused by heterogenous mutations in factor VIII gene that encodes coagulation factor VIII (F8) protein. Due to the high heterogeneity of mutations, large size (186 kb) and structural complexity of the F8 gene, direct mutation analysis is costly and time consuming. Alternatively, linkage analysis using informative polymorphic markers such as single nucleotide polymorphism (SNP) markers has been introduced as a rapid and cost effective method for hemophilia A carrier detection in families with an affected individual. Several SNP markers associated with the F8<i> </i>gene region have been studied.</span></font></font></p> <p class="MsoNormal" style="text-align: justify line-height: normal text-indent: 36pt margin: 0cm 0cm 0pt"><font size="3"><font color="#000000"><b><i><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'">Materials and Methods:</span></i></b><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-bidi-font-family: 'B Zar'"> In this exprimental study, the characteristics of A/T SNP (rs4898352) as an informative marker located in intron 18 of F8 gene region was investigated in Isfahanin population. rs4898352 marker was genotyped <span class="hps"><span style="mso-bidi-font-family: 'B Zar'">using tetra primer ARMS PCR method followed by agarose gel electrophoresis</span></span> in 140 unrelated control healthy females in mentioned population. New primers were designed for rs4898352 marker using the oligo 7 software. The allele frequency, degree of heterozygosity and Hardy-Weinberg equilibrium were estimated by use of Genepop program. The polymorphism information content (PIC) value was estimated using the Powermarker software. </span></font></font></p> <p class="MsoNormal" style="text-align: justify line-height: normal text-indent: 36pt margin: 0cm 0cm 0pt"><font size="3"><font color="#000000"><b><i><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-bidi-font-family: 'B Zar'">Results:</span></i></b><span style="font-family: 'Times New Roman' mso-bidi-font-family: 'B Zar'"> <span style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</span>The results showed that the allele frequency of rs4898352 polymorphism for A and T alleles was 0.482 and 0.518, respectively. The observed heterozigosity rate was 60%. Analysis of Hardy-Weinberg Equilibrium demonstrated that the Isfahan population was in equilibrium (p>0.05) for rs4898352 marker. Moreover, analysis of PIC value revealed that this marker could be considered as a highly informative marker in the mentioned population.</span></font></font></p> <p><font color="#000000"><b><i><span style="line-height: 115% font-family: 'Times New Roman' font-size: 11pt mso-bidi-font-family: 'B Zar' mso-fareast-font-family: Calibri mso-ansi-language: EN-US mso-fareast-language: EN-US mso-bidi-language: AR-SA">Conclusion:</span></i><span style="line-height: 115% font-family: 'Times New Roman' font-size: 11pt mso-bidi-font-family: 'B Zar' mso-fareast-font-family: Calibri mso-ansi-language: EN-US mso-fareast-language: EN-US mso-bidi-language: AR-SA"> </span></b><span style="line-height: 115% font-family: 'Times New Roman' font-size: 11pt mso-bidi-font-family: 'B Zar' mso-fareast-font-family: Calibri mso-ansi-language: EN-US mso-fareast-language: EN-US mso-bidi-language: AR-SA">Together, the data suggested that rs4898352 could be introduced as an informative marker for molecular diagnosis of hemophilia A in Isfahan Population</span></font></p> فاکتور ٨, پیوستگی ژنتیکی, هموفیلی A, جمعیت اصفهان, پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی Factor VIII, Genetic linkage, Hemophilia A, Isfahan population, Single nucleotide polymorphism 64 72 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3061-1&slc_lang=fa&sid=1 Zahra Soroush زهرا سروش zahrasoroush88@gmail.com 4600319475328460068123 4600319475328460068123 No Department of Biology, Isfahan University, Isfahan, Iran. گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران Amin Karimi امین کریمی 4600319475328460068124 4600319475328460068124 No Department of Biology, Isfahan University, Isfahan, Iran. گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران Sadegh Valian Boroujeni صادق ولیان بروجنی svallian@biol.ui.ac.ir 4600319475328460068125 4600319475328460068125 Yes PhD in Midical Genetics, Department of Biology, Isfahan University, Isfahan, Iran. دکترای ژنتیک پزشکی، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران