fa شناسایی ایزوله های بالینی کاندیدا با استفاده از روش Duplex-PCR علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle <p dir="RTL" style="margin-right:28.9pt;"><strong>زمینه و هدف:</strong> کاندیدا آلبیکنس عامل اصلی کاندیدیازیس می‌باشد. با این حال عفونت‌های ایجاد شده توسط گونه‌های غیر آلبیکنس نیز به طورچشم‌گیری افزایش یافته است. کاندیدا دابلینینسیس گونه‌ای است که از لحاظ فنوتیپی بسیار شبیه کاندیدا آلبیکنس است که به منظور درمان مناسب باید از هم متمایز گردند. هدف از این مطالعه، تفکیک و شناسایی دقیق گونه‌های کاندیدا با روش <span dir="LTR">Duplex</span> <span dir="LTR">PCR</span> به منظور دسترسی به اطلاعات اپیدمیولوژیک این گونه‌ها در نمونه‌های بالینی می‌باشد.</p> <p dir="RTL" style="margin-right:28.9pt;"><strong>مواد و روش</strong><strong>‌</strong><strong>ها:</strong> از کشت تازه مخمری، <span dir="LTR">DNA</span> قارچ به کمک روش فنل کلروفرم استخراج گردید. ناحیه فواصل رونویسی شده‌ی داخلی به روش واکنش زنجیره‌ای پلی مراز و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیرشد. محصولات حاصله در ژل آگارز الکتروفورز بررسی شده و براساس تفاوت در سایز باندهای ایجادشده،گونه‌ها شناسایی شدند.</p> <p dir="RTL" style="margin-right:28.9pt;"><strong>یافته</strong><strong>‌</strong><strong>ها:</strong> از تعدادکل 100 نمونه بالینی در مطالعه حاضر، 49 نفر مرد و 51 نفر زن بودندکه 94 نفر بیماری زمینه‌ای داشتند. دیابت (4/73 درصد)، مصرف آنتی بیوتیک (3/6 درصد) و کمبود ویتامین (3/4 درصد) فاکتورهای زمینه‌ای اصلی بودند. بیشتر نمونه‌ها مربوط به دهان (75 درصد)، واژن (5 درصد) و خون (4 درصد) بودند. تمامی ایزوله‌ها به عنوان کاندیداآلبیکنس شناسایی شدند.</p> <p dir="RTL" style="margin-right:28.9pt;"><strong>نتیجه</strong><strong>‌</strong><strong>گیری:</strong> روش<span dir="LTR">Duplex PCR</span> روشی سریع برای تشخیص وتمایز دقیق گونه‌های کاندیدا می‌باشد که در این روش احتیاجی به تست‌های اولیه فنوتیپیک مانند تولید لوله زایا، کلامیدوکونیدیا و سایرتست‌های بیوشیمیایی نبوده و برای آزمایشگاه‌های بالینی که منابع و زمان محدودی برای پاسخ‌گویی به بیمار دارند، می‌تواند جایگزین روش‌‌های سنتی گردد.</p> <p style="text-align: justify; margin-left: 3.75pt"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong>Abstract</strong></span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Background:</em></strong><em> Candida albicans </em>is still the main etiologic agent of candidiasis. However, infections of non-<em>albicans Candida</em> species are increasing. <em>Candida dubliniensis</em> is similar to <em>C. albicans</em> phenotypically and must be identified due to the better management of infection. The aim of the present study is to defferentiate and identify <em>Candida</em> species by Duplex PCR for getting an epidemiological data of <em>Candida</em> species among clinical specimens.</span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Materials and Methods:</em></strong> DNA was extracted using phenol-chloroform method from fresh colonies. Internal Transcribed Spacer region was amplified by polymerase chain reaction using specific primers. Based on differences of bands sizes on agarose gel electrophoresis, species were identified.</span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Results:</em></strong> Ninety four out of 100 patients (49 males and 51 females) had predisposing factors in the present study. Diabetes (73.4%), use of antibiotic (6.3%), vitamin deficiency (4.3%) were the main predisposing factors. The most specimens belonged to mouth (75%), vagina (5%), and blood (4%). All isolates were identified as <em>C. albicans.</em></span></span></p> <p style="text-align: justify"><span style="font-size: 14px"><span style="font-family: times new roman"><strong><em>Conclusion:</em></strong> Duplex PCR is a rapid and precise method for the detection and differentiation of <em>Candida </em>species carefully, and in this method, phenotypic tests like germ-tube and chlamydoconidia production, as well as biochemical tests are not required for clinical laboratories that have limited resources and time for response to the patients, and it can replace with the traditional methods.</span></span></p> افتراق,کاندیداآلبیکنس,کاندیدادابلینینسیس, Duplex PCR Candida albicans, Candida dubliniensis, Differentiation, Duplex PCR 8 15 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4520-1&slc_lang=fa&sid=1 Homeyra Babaei حمیرا بابایی homeyrababaei@yahoo.com 4600319475328460058279 4600319475328460058279 No Department of Medical Parasitology and Mycology, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران Javaher Chabavizadeh جواهر چعباوی زاده javaher_chabavi@yahoo.com 4600319475328460058280 4600319475328460058280 No Department of Medical Parasitology and Mycology, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران Parvin Dehghan پروین دهقان dehghan@med.mui.ac.ir 4600319475328460058281 4600319475328460058281 No Department of Medical Parasitology and Mycology, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران Rasoul Mohammadi رسول محمدی Dr.rasoul_mohammadi@yahoo.com 4600319475328460058282 4600319475328460058282 Yes Department of Medical Parasitology and Mycology, Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran گروه انگل و قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات عفونی و گرمسیری، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران