Journal of Arak University of Medical Sciences

fa شناسایی جهش بیماری‌زا c.286dupA در ژن TYR در یک فرد مبتلا به زالی پوستی- چشمی با استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم Identification of Pathogenic Mutation c.286dupA in TYR Gene in an Individual with Oculocutaneous Albinism Using Exome Sequencing علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle مقدمه: آلبینیسم چشمی- پوستی، یک بیماری ارثی با الگوی مغلوب اتوزومی است. میزان بروز این بیماری در حدود 1 در هر 17 هزار تولد است. اغلب افراد مبتلا در ایران، حاصل ازدواج خویشاوندی می‌باشند. موی سفید، پوست روشن و کاهش رنگدانه‌های عنبیه از تظاهرات اصلی این بیماری است. همچنین در معرض نور خورشید بودن، استعداد ابتلا به سرطان پوست را در این افراد افزایش می‌دهد. هدف از مطالعه حاضر، بررسی علت ژنتیکی یک فرد مبتلا به زالی چشمی- پوستی از طریق روش توالی‌یابی کل اگزوم بود. روش کار: از یک کودک مبتلا به آلبینیسم پوستی با الگوی توارث اتوزوم مغلوب، نمونه خون محیطی به مقدار 6 سی‌سی تهیه، DNA استخراج و توالی‌یابی کل اگزوم انجام شد. پس از آنالیز داده‌های توالی‌یابی اگزوم، جهش بیماری‌زا شناسایی شد. سپس جهت تأیید و تفکیک در فرد مبتلا و والدین او از روش توالی‌یابی سنگر استفاده شد. یافته‌ها: فرد مبتلا جهش بیماری‌زا (NM_000372.5):c.286dupA p.(Met96AsnfsTer73) را در اگزون شماره 1 ژن TYR به صورت هموزیگوت نشان داد. با توجه به ژن جهش یافته نوع بیماری، آلبینیسم چشمی- پوستی IA تعیین شد. همچنین والدین فرد مبتلا برای جهش مذکور هتروزیگوت بودند. نتیجه‌گیری: با استفاده از روش توالی‌یابی کل اگزوم با کارآیی بالا و سپس تائید جهش از طریق توالی‌یابی سنگر، جهش مسبب بیماری آلبینیسم چشمی- پوستی در فرد مبتلا شناسایی شد. با توجه به ازدواج خویشاوندی والدین، ناقل بودن و خطر تکرار 25 درصدی برای فرزندان آینده، از این یافته می‌توان برای اقدامات پیشگیرانه در آینده استفاده کرد. Introduction: Oculocutaneous Albinism is a hereditary disease with an autosomal recessive pattern. The incidence of this disease is about 1 in every 17 thousand births. Most of the affected people in Iran are the result of consanguineous marriages. White hair, fair skin, and reduction of iris pigments are the main manifestations of this disease. Also, exposure to sunlight increases the susceptibility of these patients to skin cancer. This study aimed to investigate the genetic cause of a person with Oculocutaneous Albinism by whole exome sequencing. Methods: A 6cc peripheral blood sample was obtained from a child with oculocutaneous Albinism with an autosomal recessive inheritance pattern. DNA extraction and whole exome sequencing were performed. After analyzing the exome sequencing data, the pathogenic mutation was identified. Then, the Sanger sequencing method was used to confirm and segregate. Results: The affected case showed homozygous pathogenic mutation (NM_000372.5): c.286dupA p.(Met96AsnfsTer73) in exon 1 of the TYR gene. Oculocutaneous albinism IA was determined according to the mutated gene. Also, the parents of the affected person were heterozygous for the mutation. Conclusions: The mutation causing oculocutaneous albinism was identified in the affected person using the high-efficiency whole exome sequencing method and then confirming the mutation through Sanger sequencing. Considering the parents' consanguineous marriage of the parents, this finding can be used for preventive measures in the future. جهش؛ آلبینیسم چشمی- پوستی؛ توالی‌یابی کل اگزوم؛ TYR Mutation, Oculocutaneous albinism, Whole exome sequencing, TYR 78 83 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-7239-3&slc_lang=fa&sid=1 Parto Hekmatpou پرتو حکمت پو partohekmatpou@gmail.com 4600319475328460089547 0009-0003-6834-2963 Yes Department of Biology, School of Science, University of Guilan, Rasht, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گیلان، رشت، ایران Parnian Hekmatpou پرنیان حکمت پو parnianhekmatpou@gmail.com 4600319475328460089548 0009-0003-6834-2963 No Department of Genetics, School of Biological Sciences, Tehran North Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران Farideh Jalali Mashayekhi فریده جلالی مشایخی mashayekhif@yahoo.com 4600319475328460089549 4600319475328460089549 No Department of Biochemistry and Genetics, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran گروه بیوشیمی و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Sahar Bayat سحر بیات bayatsahar40@gmail.com 4600319475328460089550 4600319475328460089550 No Department of Biochemistry and Genetics, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran گروه بیوشیمی و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Milad Gholami میلاد غلامی Mtu.q220@gmail.com 4600319475328460089551 4600319475328460089551 No Department of Biochemistry and Genetics, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran گروه بیوشیمی و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران