Journal of Arak University of Medical Sciences

fa شناسایی یک واریانت کدون خاتمه زودهنگام در ژن NF1 با استفاده از روش توالی یابی کل اگزوم در یک خانم مبتلا به نوروفیبروماتوز نوع 1 Identification of a premature stop codon variant in the NF1 gene using whole exome sequencing in a female with neurofibromatosis type 1 علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle مقدمه: نوروفیبروماتوز نوع 1، یک بیماری تک ژنی با الگوی اتوزوم غالب است که در اثر جهش در ژن سرکوب کننده تومور نوروفیبرومین (NF1) ایجاد می‌شود. این بیماری دارای شیوع بالا، نفوذ کامل و بیان متغیر است که با تظاهراتی همچون تومورهای نوروفیبروما، لکه‌های شیر- قهوه و ندول‌های لیش شناخته می‌شود. ژن نوروفیبرومین، یکی از بزرگ‌ترین ژن‌های انسانی و با نرخ بالای جهش‌های خود به خودی است. نوروفیبروماتوز به هر دو صورت اسپورادیک و خانوادگی رخ می‌دهد. هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی یک خانم با تظاهرات مشابه نوروفیبروماتوز از طریق توالی‌یابی کل اگزوم بود. روش کار: خانم مورد مطالعه، دارای تظاهرات مشابه نوروفیبروماتوز از پدری سالم و مادری مبتلا است که مادر او با علائم مشابه، فوت شده‌اند. از فرد مبتلا و پدر او 6 میلی‌لیتر خون محیطی اخذ شد. پس از استخراج DNA، توالی‌یابی کل اگزوم و توالی‌یابی سنگر جهت شناسایی و تأیید جهش انجام شد. یافته‌ها: نتایج توالی‌یابی اگزوم نشان داد، فرد مبتلا، واجد واریانت هتروزیگوت c.910C>T به صورت بیماری‌زا در اگزون شماره 9 ژن NF1 است. این واریانت از نوع جابه‌جایی نوکلئوتیدی است که در نهایت منجر به ایجاد کدون خاتمه زود‌هنگام می شود. نتایج سنگر پدر فرد مبتلا واریانتی را در این ژن نشان نداد. نتیجه‌گیری: واریانت c.910 C>T در ژن نوروفیبرومین منجر به تولید یک پروتئین کوتاه شده فاقد عملکرد و ایجاد تظاهرات نوروفیبروماتوز می‌گردد. گرچه این بیماری تا حدودی به درمان مقاوم است، اما با توجه به ماهیت توارثی بیماری می‌توان توسط آزمایشات قبل از لانه‌گزینی از سلامت جنین‌های آینده اطمینان حاصل کرد و همچنین برای افراد مبتلا مدیریت علائم و درمان را انجام داد. همچنین با توجه به هتروژن بودن جهشی و ژنی بیماری نوروفیبروماتوز و طول زیاد ژن NF1 جهت شناسایی علت بیماری توالی‌یابی اگزوم با کارآیی بالا جهت شناسایی واریانت‌های نقطه‌ای توصیه می‌شود. Introduction: Neurofibromatosis type 1 is an autosomal dominant disorder caused by mutations in the neurofibromin tumor suppressor gene. This condition exhibits a high prevalence, dominant penetrance, and variable expression, and is characterized by manifestations such as neurofibromas, café-au-lait spots, and Lisch nodules. Neurofibromin is one of the largest human genes with a high rate of spontaneous mutations. As a result, they can be present in both sporadic and inherited forms. The aim of this study was to genetically investigate a woman with neurofibromatosis-like manifestations by whole-exome sequencing. Methods: The patient exhibited neurofibromatosis-like manifestations, inherited from a healthy father and mother who died of similar symptoms. Peripheral blood (6ml) was collected from both the proband and her father. Following DNA extraction, the patient underwent whole-exome sequencing, whereas her father underwent Sanger sequencing. Results: The study showed that proband had a heterozygous c.910 C>T variant in the NF1 gene. This missense variant occurs in exon 9 of the gene and results in a dysfunctional protein owing a premature stop codon. Sanger sequencing of the affected father did not reveal any variant in this gene. Conclusions: The c.910 C>T variant in the neurofibromin gene leads to the production of a truncated protein that lacks function, resulting in neurofibromatosis. Although this disease is somewhat resistant to therapy, due to its hereditary, prenatal testing can help ensure the health of the fetus and provide symptom management and treatment for affected individuals. Furthermore, due to the mutational and genetic heterogeneity of neurofibromatosis and the long length of the NF1 gene, high-throughput exome sequencing is recommended to identify the cause of the disease and detect point variants. NF1, واریانت, توالی‌یابی, نوروفیبروماتوز Neurofibromatosis, NF1, Variant, Sequencing 0 0 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-7239-4&slc_lang=fa&sid=1 Samaneh Alsadat Sadati سمانه السادات ساداتی sadati4007@yahoo.com 4600319475328460093816 0009-0002-8505-0279 No Department of Genetics, Reproductive Biomedicine Research Center, Royan Institute for Reproductive Biomedicine, ACECR, Tehran, Iran گروه ژنتیک، مرکز تحقیقات پزشکی تولید مثل، پژوهشگاه تولید مثل رویان، تهران، ایران Sahar Bayat سحر بیات Bayatsahar40@gmail.com 4600319475328460093817 4600319475328460093817 No Department of Biochemistry and Genetics, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran گروه بیوشیمی و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Reyhaneh Khodadadi ریحانه خدادادی khodadadi.r96@gmail.com 4600319475328460093818 0009-0004-7361-4078 No Department of Biology, Faculty of Science, Arak University, Arak, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اراک، اراک، ایران Milad Gholami میلاد غلامی mtu.q220@gmail.com 4600319475328460093819 4600319475328460093819 Yes Department of Biochemistry and Genetics, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran گروه بیوشیمی و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران